保加利亚自然历史博物馆建立于1889年，位于其首都索菲亚，临近当地的俄罗斯教堂。该博物馆隶属于保加利亚科学院，是巴尔干半岛第一个、同时也是最大的一个自然历史博物馆。
该自然历史博物馆最初作为保加利亚斐迪南一世自然历史博物馆而建立，在1947年成为保加利亚科学院动物学研究所的一部分之前，先后有多位国内和国外的专家担任博物馆的馆长。目前，博物馆内收藏有400多个酷似活物的哺乳动物，1200多种鸟类，成千上万种昆虫和其他无脊椎动物，以及全球约四分之一的矿产样品。馆内的展览非常丰富，主要分为九大展区：近期哺乳动物化石、近期鸟类化石、鱼类、两栖类和爬行动物、昆虫、非昆虫无脊椎动物、无脊椎动物化石、矿物和岩石、植物类。
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