巴塞尔自然历史博物馆的历史可以追溯至300年前，但是馆内所收藏的一系列物品历史相当久远，可以追溯至上百万甚至上亿年前，备受考古爱好者的亲睐。
博物馆旨在收藏、保护和展览与自然历史相关的物品，涵盖了动物学、昆虫学、矿物学、人类学、骨学和古生物学，馆藏可达770万件，俨然一个自然历史大宝库。参观自然历史博物馆，如同一次探险之旅，它带我们走到我们所能到达的最远的角落，最美丽炫目的矿石就来自那里；或者回到遥远的从前，看一看恐龙们如何管理世界。馆内的收藏可谓是丰富多彩，让人目不暇接，自然的生灵小到蚂蚁，大到恐龙，全都可以观赏到，让人不得不感叹大自然的神奇。
博物馆的展出囊括了自然科学的多个角度：从地球的历史到矿石的产生，从生物灭绝到哺乳动物的出现，从巨型动物猛犸到细小的昆虫，应有尽有。
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